類天皰瘡是自體免疫疾病，起因於體內產生抗體，攻擊表皮層與真皮層交接處，用來固定表皮細胞於真皮層上的某些結構蛋白，產生發炎反應，導致表皮層與真皮層分離，形成皮膚水泡。自體免疫抗體絕大多數是自發性，少數可能由藥物、慢性皮膚發炎性疾病、紫外光或放射線治療等引起。